同济大学医学院有着悠久的历史，1907年成立的“德文医学堂”是同济医学专业的开端，也是同济大学的雏形。历经百年沧桑，在新世纪之初，医学重新扎根于同济大学，成为重点建设的学科，走上复兴之路。

学院拥有一批由国内外医学精英组成的师资队伍，包括中国科学院院士，“国家高层次人才计划”、“杰出青年基金”获得者、“长江学者”特聘教授、“973和重点研发首席科学家”等名师，同时引进欧美等国家外籍教师加入教学和科研团队。与生命科学、工科和理科院系的合作更彰显同济医学人才培养的特色。多家三甲附属医院（附属上海市第十人民医院、附属东方医院、附属同济医院、附属第一妇婴保健院、附属上海市肺科医院、附属杨浦医院等）具有大批临床专家和丰富的临床资源，为培养未来医学家提供宽广的平台。经过近十多年的发展，聚焦于医学转化研究，医学院承担了一系列的国家重大科技攻关项目，包括重大专项、重大科技支撑计划、863和973计划以及重点研发计划等，取得了丰硕的科研成果，在国际顶级杂志Cell、Nature、Science等上均发表了高质量论文。

医学院设有干细胞中心、脑与脊髓创新研究中心、癌症中心、心脏中心四大科研中心：

1、干细胞中心：成立于2009年的干细胞中心现有华东干细胞库和中美干细胞联合实验室，8家附属医院的干细胞转化中心为干细胞从基础研究走向临床搭建起一座桥梁。在国家、上海市和学校的大力支持下，同济大学医学院在干细胞研究领域汇聚了一支由院士（1人）、“国家高层次人才计划”（4人）、长江学者（2人）、杰出青年（4人）、“973”和重大科学研究计划首席（4人）等组成的顶尖干细胞研究队伍。干细胞中心已经取得一系列重要研究成果：1）利用微量组学方法揭示了胚胎发育和干细胞静息与激活机制；2）在体细胞重编程机制研究中取得重要突破；3）在体细胞转分化研究中取得重要突破；4）在基因修饰大动物模型和体细胞核移植研究中取得重要进展。基于前期的研究成果，干细胞中心将紧密围绕当今干细胞领域的主要核心问题：1）深入研究早期胚胎发育的表观遗传调控机制；2）探索体细胞重编程和转分化的分子机制，并进一步优化重编程与转分化技术；3）揭示多能干细胞分化为神经细胞以及神经干细胞自我更新与分化的分子机制，并以老年痴呆，帕金森氏综合症和脊髓损伤为模型深入研究干细胞在治疗再生障碍性疾病中的作用与机制。

2、脑与脊髓创新研究中心：按照中国脑计划的总体部署，以脊髓与脑损伤，帕金森、老年痴呆等神经退行性疾病和精神性疾病为主要研究方向，以神经病理机制和神经环路重建研究为重点，以干细胞和表观遗传研究为特色，以转化医学思想和机制体制创新为突破，从干细胞与生物材料、遗传学标记与神经环路示踪、表观遗传调控与神经发育、神经影像及神经电生理监测、神经行为及运动功能评价等方面搭建研究平台，引进及培养具有国际水平的博士后，构建临床-基础紧密融合的联合研究团队，力争建成国家级脑与脊髓创新研究中心。

3、癌症中心：该中心是同济大学“十三五”建设“双一流”大学医学口三个重点建设项目之一，依托同济大学医学院，整合各附属医院肿瘤临床、基础、转化研究团队，充分发挥同济大学医工结合优势，汇聚同济大学在癌症方面的临床、研究及转化力量，聚焦于消化道肿瘤、肺癌、妇科肿瘤等方向，以肿瘤转移及微环境为主要研究特色，形成以临床、基础及转化为目标的同济特色的肿瘤研究体系，建立国家级临床医学中心。

4、心脏中心：该中心聚焦心脏病学领域的基础性和关键性问题,主题是心脏病生物治疗。基地未来的研究方向包括：心脏生物起搏、心肌再生、心肌细胞亚细胞器塑形等。创立自律细胞基因修饰或者细胞移植治疗心律失常的新观念、新技术；研制体细胞重编程、干细胞定向分化或心肌细胞增殖干预心肌梗死或者心力衰竭的新理论、新方法；催生心肌细胞特异的亚细胞器塑形逆转重大心脏疾病的新思维、新手段，引领世界心脏病生物治疗领域。