研究工作围绕基于蛋白质组学技术的疾病蛋白修饰动态调控机制和药物精准干预策略研究，研究工作突破了对蛋白翻译后修饰在生理病理过程中的多样性、动态性、交互性等复杂特征的认知局限，揭示了靶向蛋白修饰在克服肿瘤耐药、实现疾病精准治疗中的重要性和普遍性。

主要研究方向：

蛋白质组学新技术开发，以及在肿瘤演进的分子机制、个性化药物治疗及生物标志物研究

中国病理生理学会蛋白质修饰与疾病专委会青年工作小组副组长

中国药理学会分析药理学专业委员会常务委员

中国生化与分子生物学会分子系统生物学专委会理事

中国生化与分子生物学会蛋白质组学专委会理事

中国生物物理学会表型组学分会理事

上海市药学会生化药物专委会副主任委员

上海市药理学会理事

国家蛋白质科学中心（北京）用户委员会 主任

《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》编委

《药学进展》青年编委

主要从事基于蛋白质组学技术的疾病蛋白修饰动态调控机制和药物精准干预策略研究，发表SCI论文150余篇，以通讯作者发表在Cell (2018, 2020)、Cell Metab (2021)、Nat Cancer (2024)、 Mol Cell (2021, 2022)、Nat Chem (2023)、Sci Transl Med (2024)、Nat Commun (2018, 2024)、Angew Chem Int Ed Engl (2025a, 2025b)、J Am Chem Soc (2023, 2025)等国际学术期刊，总引用率1.7万余次，H因子53，授权专利7项。研究工作入选《中国2020年度重要医学进展》，入选爱思唯尔（Elsevier） “中国高被引学者”。获国家杰出青年科学基金、中国青年科技奖、万人计划科技创新领军人才、科技部中青年科技创新领军人才、国家海外高层次青年人才计划、教育部自然科学一等奖、上海青年科技英才（基础研究类）、药明康德生命化学学者奖、中源协和生命医学创新突破奖、中国药学会科学技术奖一等奖、上海市优秀学术带头人、中科院上海分院杰出青年科技创新人才、上海市浦江人才、上海市药学科技一等奖等荣誉。承担基金委卓越研究群体项目（原基础科学中心项目）、创新群体项目、重大研究计划，国家973重点基础研究发展计划、国家重点研发计划“精准医学研究”、国家“新药创制”重大科技专项等课题。

代表性论文

* 通讯作者，#第一作者：

1. Xu Y, Zhao W, Nie H, Wang J, Fu J, Hu H, Liu Z, Tao S, Zhang M, Zhou Y, Li J*, Tan M*, Chen X*. Cross-Linking Profiling of Molecular Glue Degrader-Induced E3 Ligase Interactome to Expand Target Space. Angew Chem Int Ed Engl. 2025, 64(22):e202505053.

2. Xu Y, Hu H, Ran Y, Zhao W, Guo A, Nie H, Zhai L, Yin G, Cheng J, Tao S, Yang B*, Tan M*, Chen X*. Visible-Light-Controlled Lysine-Selective Crosslinking Decodes Protein Complexes and Dynamic Interactomes in Live Cells. Angew Chem Int Ed Engl. 2025, 64(32):e202507254.

3. Lu Y, Xu J, Li Y, Wang R, Dai C, Zhang B, Zhang X, Xu L, Tao Y, Han M, Guo R,Wu Q, Wu L*, Meng Z*, Tan M*, Li J*. DRAK2 suppresses autophagy by phosphorylating ULK1 at Ser56 to diminish pancreatic β cell function upon overnutrition. Sci Transl Med. 2024,16:eade8647

4. Hu H, Hu W, Guo AD, Zhai L, Ma S, Nie HJ, Zhou BS, Liu T, Jia X, Liu X, Yao X, Tan M*, Chen X*. Spatiotemporal and direct capturing global substrates of lysine-modifying enzymes in living cells. Nat Commun. 2024, 15:1465.

5. Guo A, Yan K, Hu, H, Zhai L, Hu T, Su,H, Chi Y, Zha,J, Xu Y, Zhao,Y Lu X, Xu Y, Zhang J, Tan M*, Chen X*. Spatiotemporal and global profiling of DNA-protein interactions enables discovery of low-affinity transcription factors. Nat Chem 2023, 15:803-814

6. Jiang L, Liu S, Jia X, Gong Q, Wen X, Lu W, Yang J, Wu X, Wang X, Suo Y, Li Y, Uesugi M, Qu ZB, Tan M,* Lu X,* Zhou L.* ABPP-CoDEL: Activity-Based Proteome Profiling-Guided Discovery of Tyrosine-Targeting Covalent Inhibitors from DNA- Encoded Libraries. J Am Chem Soc. 2023,145, 46, 25283–25292

7. Zhou Q, Hao B, Cao X, Gao L, Yu Z, Zhao Y, Zhu M, Zhong G, Chi F, Dai X, Mao J, Zhu Y, Rong P, Chen L, Bai X, Ye C, Chen S, Liang T, Li L, Feng XH*, Tan M*, Zhao B*. Energy sensor AMPK gamma regulates translation via phosphatase PPP6C independent of AMPK alpha. Mol Cell. 2022, 82:4700-4711

8. Liu Z, Liu Y, Qian L, Jiang S, Gai X, Ye S, Chen Y, Wang X, Zhai L, Xu J, Pu C, Li J, He F, Huang M*, and Tan M*. A proteomic and phosphoproteomic landscape of KRAS mutant cancers identifies combination therapies. Mol Cell. 2021, 81: 4076-4090

9. Li Y, Xu J, Lu Y, Bian H, Yang L, Wu H, Zhang X, Zhang B, Xiong M, Chang Y, Tang J, Yang F, Zhao L, Li J, Gao X, Xia M*, Tan M*, Li J*. DRAK2 aggravates nonalcoholic fatty liver disease progression through SRSF6-associated RNA alternative splicing. Cell Metab. 2021 33: 2004–2020.

10. Xu J, Zhang C, Wang X, Zhai L, Ma Y, Mao Y, Qian K, Sun C, Liu Z, Jiang S, Wang M, Feng L, Zhao L, Liu P, Wang B, Zhao X, Xie H, Yang X, Zhao L, Chang Y, Jia J, Wang X, Zhang Y, Wang Y, Yang Y, Wu Z, Yang L, Liu B, Zhao T, Ren S, Sun A, Zhao Y, Ying W, Wang F, Wang G, Zhang Y, Cheng S, Qin J, Qian X, Wang Y*, Li J*, He F*, Xiao T*, Tan M*. Integrative proteomic characterization of human lung adenocarcinoma. Cell 2020, 182: 245-261

11. Huang X, Yan J, Zhang M, Wang Y, Chen Y, Fu X, Wei R, Zheng XL, Liu Z, Zhang X, Yang H, Hao B, Shen YY, Su Y, Cong X, Huang M, Tan M*, Ding J*, Geng M*. Targeting Epigenetic Crosstalk as a Therapeutic Strategy for EZH2-Aberrant Solid Tumors. Cell 2018，175:186-199.

12. Liu B, Jiang S, Li M, Xiong X, Zhu M, Li D, Zhao L, Qian L, Zhai L, Li J, Lu H, Sun S, Lin J, Lu Y *, Li X*, Tan M*. Proteome-wide analysis of USP14 substrates revealed its role in hepatosteatosis. Nat Commun 2018, 9: 4770

13. Tan, M.#, Peng, C.#, Anderson, K.A.#, Chhoy, P., Xie, Z., Dai, L., Park, J.S., Chen, Y., Huang, H., Zhang, Y., Ro, J., Wagner, G.R., Green, M.F., Madsen, A.S., Schmiesing, J., Peterson, B.S., Xu, G., Ilkayeva, O.R., Muehlbauer, M.J., Braulke, T., Mühlhausen, C., Backos, D.S., Olsen, C.A., McGuire, P.J., Pletcher, S.D., Lombard, D.B., Hirschey, M.D.*, Zhao, Y*. Lysine Glutarylation Is a Protein Post-Translational Modification Regulated by SIRT5. Cell Metab. 2014,19: 605-617

14. Tan M.#, Luo H.#, Lee S.#, Jin F., Yang J.S., Montellier E., Buchou T., Cheng Z., Rousseaux S., Rajagopal N., Lu Z., Ye Z., Zhu Q., Wysocka J., Ye Y., Khochbin S., Ren B., Zhao Y*. Identification of 67 histone marks and histone lysine crotonylation as a new type of histone modification. Cell 2011, 146, 1016-1028

15. Zhang, Z.#, Tan, M.#, Xie, Z., Dai, L., Chen, Y., Zhao, Y.*. Identification of lysine succinylation as a new post-translational modification. Nat Chem Biol 2011, 7, 58-63