免疫与代谢调控：

研究免疫与代谢相互作用的调控网络及分子机制；在细胞水平，探究细胞内代谢通路对免疫细胞活化及功能的影响和分子机制；聚焦代谢分子调控免疫细胞的功能影响疾病的发生和发展。

Immunity and metabolic regulation：

Focus on the regulatory network and molecular mechanism of immune and metabolic interaction; To explore the influence and molecular mechanism of intracellular metabolic pathways on immune cell activation and function at the cell level; Focus on the function of metabolic molecules to regulate immune cells to influence the occurrence and development of diseases.

同济大学副教授；上海市肺科医院兼聘研究员；硕士和博士生导师；上海市东方英才团队；国家科技部评审专家；国家自然科学基金评审专家；上海市科委评审专家；上海市科学技术奖励评审专家；中国免疫学会会员；中国细胞生物学会会员；中国科学院上海生命科学研究院副研究员，上海交通大学医学院副研究员。

Associate Professor, Tongji University; The part-time Research Professor of Shanghai Pulmonary Hospital; Master and Doctoral Supervisor; Shanghai Oriental Talent Team； National Natural Science Foundation of China Review Expert; Shanghai Science and Technology Commission Evaluation Expert; Shanghai Science and Technology Award Review Expert; Member of the Chinese Society of Immunology; Member of the Chinese Society of Cell Biology; Associate Professor of Shanghai Institutes for Biological Sciences of Chinese Academy of Sciences (SIBS, CAS), Associate Professor of Shanghai Jiaotong University School of Medicine.

课题组长期致力于免疫代谢调控领域研究，在此过程中聚焦代谢产物通过调控免疫细胞的功能进而改变疾病的发生发展进程，最终发现有效药物靶点；已经在该领域奠定了扎实的理论和实践基础，并取得一系列原创成果，如发现结核菌利用代谢物调控宿主适应性免疫来进行免疫逃避的新机制等，在领域内产生了重要国际影响。研究工作共发表第一作者(含共同)和通讯作者(含共同)论文17篇。包括国际微生物学和免疫学领域重要SCI杂志《Nature Microbiology》（2025）、《Nature Microbiology》（2024）、《Journal of Immunology》、《Frontiers in immunology》、 《Immunology and cell biology》和《Scientific Reports》等。研究期间主持多项课题基金，包括国家自然科学基金重大项目、国家自然科学基金面上项目、国家自然科学基金青年项目和上海市卫计委研究基金面上项目等。

主持科研项目：

国家自然科学基金重大项目（2024.1-2028.12）, 子课题负责人 , 175万

国家自然科学基金面上项目 （2016.1-2019.12）, 项目负责人, 71.4万

国家自然科学基金青年项目 （2009.1-2011.12）, 项目负责人, 20万

上海市卫健委临床研究专项 （2021.1-2023.12; 2016.1-2018.12）, 项目负责人 ,15万

同济大学国家级重大科技成果培育项目（2021.1-2021.12），项目负责人，10万

同济大学自主原创基础研究项目（2024.4-2026.3），项目负责人，12万

上海交通大学医学院附属瑞金医院研究基金（2018.2-2021.2），项目负责人，50万

中国博士后科学基金一等资助（2008.9-2010.2），项目负责人，5万

代表性论文：

Hongyu Cheng#; Shenzhi Li#; Hongjie Liu#; Meiyi Yan#; Jingxiang Wang#; Jingping Huang; Shanshan Liu; Yifan Yang; Xinyu Cao; Pengfei Cui; Yuanna Cheng; Zhonghua Liu; Jie Wang; Xiaochen Huang; Lin Wang; Lianhua Qin; Ruijuan Zheng; Carl G Feng; Qiang Zou; Yicheng Sun*; Zhe Ji*; Hua Yang*; Baoxue Ge*; （2025）. Mycobacterium tuberculosis-derived linoleic acid increases regulatory T cell function to promote bacterial survival within macrophages, Nature Microbiology. doi: 10.1038/s41564-025-02140-2

Hongyu Cheng#, Zhe Ji#, Yang Wang, Shenzhi Li, Tianqi Tang, Fei Wang, Cheng Peng, Xiangyang Wu, Yuanna Cheng, Zhonghua Liu, Mingtong Ma, Jie Wang, Xiaochen Huang, Lin Wang, Lianhua Qin, Haipeng Liu, Jianxia Chen, Ruijuan Zheng, Carl G. Feng, Xia Cai, Di Qu, Lilin Ye*, Hua Yang* and Baoxue Ge* (2024). Mycobacterium tuberculosis produces D-serine under hypoxia to limit CD8+ T cell-dependent immunity in mice. Nature Microbiology, 9(7): 1856-1872. Doi: 10.1038/s41564-024-01701-1 (Highlighted by Nature Immunology)

Ji, Z. *, Zhou, C., Niu, H., Wang, J., Shen, L. * (2020). Flow Cytometric Analysis of Lymphocyte Infiltration in Central Nervous System during Experimental Autoimmune Encephalomyelitis. J. Vis. Exp. 165, e61050: 1-10 doi:10.3791/61050.

Zhe Ji#*, Shuai Wu#, Yaru Xu, Jingjing Qi, Xiaohui Su, Lei Shen* (2019). Obesity promotes EAE through IL-6 and MCP-1-mediated T cells infiltration. Front. Immunol. 10:1881. doi: 10.3389/fimmu.2019.01881.

Z. Ji, Z.Q. Fan, Y. Zhang, R.H. Yu, H.H. Yang, C.H. Zhou, J. Luo, Z.J. Ke (2014). Thiamine Deficiency Promotes T Cell Infiltration in Experimental Autoimmune Encephalomyelitis: the Involvement of CCL2. Journal of Immunology, 193:2157-2167.

Z. Ji, Z.J. Ke, J.G. Geng. (2012). SAP Suppresses the Development of Experimental Autoimmune Encephalomyelitis in C57BL6 Mice. Immunology and cell biology, 90(4): 388-395. (Highlighted by A-IMBN and NPG Nature Asia-Pacific)