感染免疫与代谢调控：研究免疫与代谢相互作用的调控网络及分子机制；在细胞水平，探究细胞内代谢通路对免疫细胞活化及功能的影响和分子机制；聚焦代谢分子调控免疫细胞的功能影响感染性疾病的发生和发展。

同济大学副教授；国家自然科学基金评审专家；上海市科委评审专家；上海市科学技术奖励评审专家；中国免疫学会会员；中国细胞生物学会会员；曾任中国科学院上海生命科学研究院副研究员，上海交通大学医学院副研究员。

课题组致力于免疫代谢调控领域研究，通过调控代谢产物的水平影响免疫细胞的功能进而改变疾病的发生发展进程，在此过程中寻找有效药物靶点。已经在该领域奠定了扎实的理论和实践基础，并取得了突出的研究成果。研究工作共发表第一作者和通讯作者论文15篇。包括国际免疫学领域重要SCI杂志《Journal of Immunology》、《Frontiers in immunology》、 《Immunology and cell biology》和《Scientific Reports》等。研究期间作为负责人主持6项课题基金，包括两项国家自然科学基金项目和两项上海市卫计委研究基金面上项目等，同时作为主要参与者参加过973项目、863项目以及国自然项目等研究。

代表性论文：

1. Zhe Ji#*, Shuai Wu#, Yaru Xu, Jingjing Qi, Xiaohui Su, Lei Shen* (2019). Obesity promotes EAE through IL-6 and MCP-1-mediated T cells infiltration. Front. Immunol. 10:1881. doi: 10.3389/fimmu.2019.01881.

2. Zhe Ji, Lin Yuan, Xiong Lu, Hanqing Ding, Jia Luo, Zun-Ji Ke (2018). Binge Alcohol Exposure Causes Neurobehavioral Deficits and GSK3β Activation in the Hippocampus of Adolescent Rats. Scientific Reports, 8:3088. DOI:10.1038/s 41598-018-21341-w.

3. Z. Ji, Z.Q. Fan, Y. Zhang, R.H. Yu, H.H. Yang, C.H. Zhou, J. Luo, Z.J. Ke (2014). Thiamine Deficiency Promotes T Cell Infiltration in Experimental Autoimmune Encephalomyelitis: the Involvement of CCL2. Journal of Immunology, 193:2157-2167.

4. Z. Ji, Z.J. Ke, J.G. Geng. (2012). SAP Suppresses the Development of Experimental Autoimmune Encephalomyelitis in C57BL6 Mice. Immunology and cell biology, 90(4): 388-395. (Highlighted by A-IMBN and NPG Nature Asia-Pacific)